Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms