Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169 ms