Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140 ms