Protein–RNA interactions for Protein: Q12532

RQC2, Ribosome quality control complex subunit 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RQC2Q12532 PET111YMR257C 2403 nt1.41□□□□□ -2.18
RQC2Q12532 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt1.41□□□□□ -2.18
RQC2Q12532 YMR160WYMR160W 2451 nt1.4□□□□□ -2.19
RQC2Q12532 YNL266WYNL266W 420 nt1.4□□□□□ -2.19
RQC2Q12532 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.38□□□□□ -2.19
RQC2Q12532 BEM2YER155C 6504 nt1.37□□□□□ -2.19
RQC2Q12532 PMP2YEL017C-A 132 nt1.35□□□□□ -2.19
RQC2Q12532 MLP1YKR095W 5628 nt1.33□□□□□ -2.2
RQC2Q12532 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.32□□□□□ -2.2
RQC2Q12532 CSE1YGL238W 2883 nt1.31□□□□□ -2.2
RQC2Q12532 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.31□□□□□ -2.2
RQC2Q12532 SEC10YLR166C 2616 nt1.31□□□□□ -2.2
RQC2Q12532 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt1.3□□□□□ -2.2
RQC2Q12532 YJR029WYJR029W 5268 nt1.29□□□□□ -2.2
RQC2Q12532 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.29□□□□□ -2.2
RQC2Q12532 snR61snR61 90 nt1.27□□□□□ -2.21
RQC2Q12532 YBR178WYBR178W 375 nt1.25□□□□□ -2.21
RQC2Q12532 ORC3YLL004W 1851 nt1.24□□□□□ -2.21
RQC2Q12532 EST1YLR233C 2100 nt1.24□□□□□ -2.21
RQC2Q12532 snR69snR69 101 nt1.22□□□□□ -2.21
RQC2Q12532 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.17□□□□□ -2.22
RQC2Q12532 TFB5YDR079C-A 219 nt1.14□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt1.14□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt1.14□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt1.14□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt1.14□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt1.14□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt1.14□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt1.14□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt1.14□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt1.14□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt1.14□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt1.14□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 SBH1YER087C-B 249 nt1.13□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.12□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.11□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 ESP1YGR098C 4893 nt1.1□□□□□ -2.23
RQC2Q12532 MLP2YIL149C 5040 nt1.09□□□□□ -2.24
RQC2Q12532 RDS3YPR094W 324 nt1.04□□□□□ -2.24
RQC2Q12532 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt1.02□□□□□ -2.25
RQC2Q12532 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.01□□□□□ -2.25
RQC2Q12532 YMR326CYMR326C 309 nt1□□□□□ -2.25
RQC2Q12532 snR81snR81 201 nt0.98□□□□□ -2.25
RQC2Q12532 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.98□□□□□ -2.25
RQC2Q12532 YBL109WYBL109W 336 nt0.97□□□□□ -2.25
RQC2Q12532 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.96□□□□□ -2.26
RQC2Q12532 AI1Q0050 2505 nt0.96□□□□□ -2.26
RQC2Q12532 UTP10YJL109C 5310 nt0.95□□□□□ -2.26
RQC2Q12532 YHR217CYHR217C 462 nt0.91□□□□□ -2.26
RQC2Q12532 FMP27YLR454W 7887 nt0.9□□□□□ -2.26
RQC2Q12532 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.88□□□□□ -2.27
RQC2Q12532 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt0.87□□□□□ -2.27
RQC2Q12532 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.85□□□□□ -2.27
RQC2Q12532 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.85□□□□□ -2.27
RQC2Q12532 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.83□□□□□ -2.28
RQC2Q12532 SOV1YMR066W 2697 nt0.79□□□□□ -2.28
RQC2Q12532 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.78□□□□□ -2.28
RQC2Q12532 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.78□□□□□ -2.28
RQC2Q12532 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.77□□□□□ -2.29
RQC2Q12532 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.77□□□□□ -2.29
RQC2Q12532 MYO1YHR023W 5787 nt0.77□□□□□ -2.29
RQC2Q12532 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.64□□□□□ -2.31
RQC2Q12532 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.61□□□□□ -2.31
RQC2Q12532 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.61□□□□□ -2.31
RQC2Q12532 snR50snR50 90 nt0.58□□□□□ -2.32
RQC2Q12532 THO2YNL139C 4794 nt0.54□□□□□ -2.32
RQC2Q12532 snR62snR62 100 nt0.44□□□□□ -2.34
RQC2Q12532 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.42□□□□□ -2.34
RQC2Q12532 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.41□□□□□ -2.34
RQC2Q12532 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.4□□□□□ -2.35
RQC2Q12532 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.39□□□□□ -2.35
RQC2Q12532 snR67snR67 82 nt0.31□□□□□ -2.36
RQC2Q12532 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.31□□□□□ -2.36
RQC2Q12532 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.3□□□□□ -2.36
RQC2Q12532 snR45snR45 172 nt0.3□□□□□ -2.36
RQC2Q12532 snR47snR47 99 nt0.26□□□□□ -2.37
RQC2Q12532 snR128snR128 126 nt0.22□□□□□ -2.37
RQC2Q12532 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.22□□□□□ -2.37
RQC2Q12532 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.14□□□□□ -2.39
RQC2Q12532 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.09□□□□□ -2.4
RQC2Q12532 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.08□□□□□ -2.4
RQC2Q12532 snR38snR38 95 nt0.07□□□□□ -2.4
RQC2Q12532 RPL41AYDL184C 78 nt0.05□□□□□ -2.4
RQC2Q12532 SKI7YOR076C 2244 nt0.02□□□□□ -2.41
RQC2Q12532 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.01□□□□□ -2.41
RQC2Q12532 YKL225WYKL225W 348 nt-0.15□□□□□ -2.43
RQC2Q12532 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.28□□□□□ -2.45
RQC2Q12532 SBH2YER019C-A 267 nt-0.32□□□□□ -2.46
RQC2Q12532 snR64snR64 101 nt-0.37□□□□□ -2.47
RQC2Q12532 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.37□□□□□ -2.47
RQC2Q12532 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.38□□□□□ -2.47
RQC2Q12532 URB1YKL014C 5295 nt-0.52□□□□□ -2.49
RQC2Q12532 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.56□□□□□ -2.5
RQC2Q12532 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.61□□□□□ -2.51
RQC2Q12532 snR53snR53 91 nt-0.61□□□□□ -2.51
RQC2Q12532 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
RQC2Q12532 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
RQC2Q12532 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
RQC2Q12532 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.79□□□□□ -2.54
RQC2Q12532 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.81□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms