Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

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Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 SIP4YJL089W 2490 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 NUP192YJL039C 5052 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 NIP1YMR309C 2439 nt1.04□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 BUL2YML111W 2763 nt1.02□□□□□ -2.25
TRM13Q12383 VAM6YDL077C 3150 nt1□□□□□ -2.25
TRM13Q12383 NST1YNL091W 3723 nt1□□□□□ -2.25
TRM13Q12383 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.98□□□□□ -2.25
TRM13Q12383 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.98□□□□□ -2.25
TRM13Q12383 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM13Q12383 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM13Q12383 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM13Q12383 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM13Q12383 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM13Q12383 PAU12YGR294W 363 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM13Q12383 ORC3YLL004W 1851 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM13Q12383 SCC2YDR180W 4482 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM13Q12383 LTE1YAL024C 4308 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM13Q12383 YPR117WYPR117W 7470 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM13Q12383 RKR1YMR247C 4689 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM13Q12383 snR64snR64 101 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM13Q12383 snR53snR53 91 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM13Q12383 RPL41AYDL184C 78 nt0.91□□□□□ -2.26
TRM13Q12383 BEM2YER155C 6504 nt0.9□□□□□ -2.26
TRM13Q12383 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.9□□□□□ -2.27
TRM13Q12383 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.88□□□□□ -2.27
TRM13Q12383 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.88□□□□□ -2.27
TRM13Q12383 snR50snR50 90 nt0.88□□□□□ -2.27
TRM13Q12383 PET111YMR257C 2403 nt0.88□□□□□ -2.27
TRM13Q12383 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.87□□□□□ -2.27
TRM13Q12383 YKL225WYKL225W 348 nt0.87□□□□□ -2.27
TRM13Q12383 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.85□□□□□ -2.27
TRM13Q12383 MYO1YHR023W 5787 nt0.84□□□□□ -2.28
TRM13Q12383 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.84□□□□□ -2.28
TRM13Q12383 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM13Q12383 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM13Q12383 MLP1YKR095W 5628 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM13Q12383 IML1YJR138W 4755 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM13Q12383 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.81□□□□□ -2.28
TRM13Q12383 AI1Q0050 2505 nt0.81□□□□□ -2.28
TRM13Q12383 DOP1YDR141C 5097 nt0.81□□□□□ -2.28
TRM13Q12383 MLP2YIL149C 5040 nt0.78□□□□□ -2.28
TRM13Q12383 PAU24YBR301W 363 nt0.77□□□□□ -2.29
TRM13Q12383 snR67snR67 82 nt0.71□□□□□ -2.3
TRM13Q12383 SKI7YOR076C 2244 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM13Q12383 snR38snR38 95 nt0.68□□□□□ -2.3
TRM13Q12383 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM13Q12383 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM13Q12383 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
TRM13Q12383 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.64□□□□□ -2.31
TRM13Q12383 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM13Q12383 IQG1YPL242C 4488 nt0.59□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 YMR160WYMR160W 2451 nt0.58□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.57□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.57□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 UTP10YJL109C 5310 nt0.57□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM13Q12383 FMP27YLR454W 7887 nt0.52□□□□□ -2.33
TRM13Q12383 UTP20YBL004W 7482 nt0.52□□□□□ -2.33
TRM13Q12383 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM13Q12383 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt0.48□□□□□ -2.33
TRM13Q12383 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM13Q12383 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM13Q12383 ESP1YGR098C 4893 nt0.36□□□□□ -2.35
TRM13Q12383 snR128snR128 126 nt0.36□□□□□ -2.35
TRM13Q12383 SOV1YMR066W 2697 nt0.33□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 PAU9YBL108C-A 129 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.29□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.29□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.29□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.29□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.29□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.29□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.29□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.29□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.29□□□□□ -2.36
TRM13Q12383 snR75snR75 89 nt0.27□□□□□ -2.37
TRM13Q12383 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.25□□□□□ -2.37
TRM13Q12383 YOL014WYOL014W 375 nt0.19□□□□□ -2.38
TRM13Q12383 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.19□□□□□ -2.38
TRM13Q12383 THO2YNL139C 4794 nt0.19□□□□□ -2.38
TRM13Q12383 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.18□□□□□ -2.38
TRM13Q12383 SBH2YER019C-A 267 nt0.14□□□□□ -2.39
TRM13Q12383 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.13□□□□□ -2.39
TRM13Q12383 snR77snR77 88 nt0.07□□□□□ -2.4
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