Protein–RNA interactions for Protein: Q12272

TPT1, tRNA 2'-phosphotransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPT1Q12272 YBL053WYBL053W 375 nt0.09□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.08□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.08□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.06□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 AI1Q0050 2505 nt0.06□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 STF2YGR008C 255 nt0.04□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.04□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.03□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.03□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.03□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.03□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.03□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.03□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.03□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.03□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.03□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 YGR151CYGR151C 336 nt0.03□□□□□ -2.4
TPT1Q12272 snR69snR69 101 nt0□□□□□ -2.41
TPT1Q12272 THO2YNL139C 4794 nt-0□□□□□ -2.41
TPT1Q12272 snR128snR128 126 nt-0.01□□□□□ -2.41
TPT1Q12272 YGR164WYGR164W 336 nt-0.02□□□□□ -2.41
TPT1Q12272 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.02□□□□□ -2.41
TPT1Q12272 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.03□□□□□ -2.41
TPT1Q12272 YNL337WYNL337W 255 nt-0.03□□□□□ -2.41
TPT1Q12272 YNL338WYNL338W 159 nt-0.04□□□□□ -2.42
TPT1Q12272 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.06□□□□□ -2.42
TPT1Q12272 YNL205CYNL205C 423 nt-0.06□□□□□ -2.42
TPT1Q12272 YOL014WYOL014W 375 nt-0.07□□□□□ -2.42
TPT1Q12272 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.1□□□□□ -2.43
TPT1Q12272 RDS3YPR094W 324 nt-0.1□□□□□ -2.43
TPT1Q12272 SEC10YLR166C 2616 nt-0.12□□□□□ -2.43
TPT1Q12272 snR45snR45 172 nt-0.13□□□□□ -2.43
TPT1Q12272 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.15□□□□□ -2.43
TPT1Q12272 YBR178WYBR178W 375 nt-0.15□□□□□ -2.43
TPT1Q12272 Q0032Q0032 291 nt-0.17□□□□□ -2.44
TPT1Q12272 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.17□□□□□ -2.44
TPT1Q12272 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.19□□□□□ -2.44
TPT1Q12272 snR50snR50 90 nt-0.19□□□□□ -2.44
TPT1Q12272 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.2□□□□□ -2.44
TPT1Q12272 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.2□□□□□ -2.44
TPT1Q12272 YNL266WYNL266W 420 nt-0.2□□□□□ -2.44
TPT1Q12272 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.22□□□□□ -2.44
TPT1Q12272 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.24□□□□□ -2.45
TPT1Q12272 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.25□□□□□ -2.45
TPT1Q12272 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.26□□□□□ -2.45
TPT1Q12272 SBH2YER019C-A 267 nt-0.27□□□□□ -2.45
TPT1Q12272 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.27□□□□□ -2.45
TPT1Q12272 YOR225WYOR225W 330 nt-0.3□□□□□ -2.46
TPT1Q12272 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.3□□□□□ -2.46
TPT1Q12272 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.33□□□□□ -2.46
TPT1Q12272 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.35□□□□□ -2.47
TPT1Q12272 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.35□□□□□ -2.47
TPT1Q12272 YLR294CYLR294C 330 nt-0.37□□□□□ -2.47
TPT1Q12272 snR67snR67 82 nt-0.39□□□□□ -2.47
TPT1Q12272 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.41□□□□□ -2.48
TPT1Q12272 URB1YKL014C 5295 nt-0.44□□□□□ -2.48
TPT1Q12272 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.5□□□□□ -2.49
TPT1Q12272 SKI7YOR076C 2244 nt-0.52□□□□□ -2.49
TPT1Q12272 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.57□□□□□ -2.5
TPT1Q12272 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.58□□□□□ -2.5
TPT1Q12272 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.61□□□□□ -2.51
TPT1Q12272 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.62□□□□□ -2.51
TPT1Q12272 YNL170WYNL170W 396 nt-0.63□□□□□ -2.51
TPT1Q12272 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.67□□□□□ -2.52
TPT1Q12272 snR81snR81 201 nt-0.69□□□□□ -2.52
TPT1Q12272 ATP8Q0080 147 nt-0.72□□□□□ -2.52
TPT1Q12272 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.72□□□□□ -2.52
TPT1Q12272 snR161snR161 161 nt-0.73□□□□□ -2.53
TPT1Q12272 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.76□□□□□ -2.53
TPT1Q12272 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.76□□□□□ -2.53
TPT1Q12272 RPL41AYDL184C 78 nt-0.8□□□□□ -2.54
TPT1Q12272 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.81□□□□□ -2.54
TPT1Q12272 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.81□□□□□ -2.54
TPT1Q12272 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.81□□□□□ -2.54
TPT1Q12272 snR33snR33 183 nt-0.81□□□□□ -2.54
TPT1Q12272 snR47snR47 99 nt-0.81□□□□□ -2.54
TPT1Q12272 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.81□□□□□ -2.54
TPT1Q12272 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.82□□□□□ -2.54
TPT1Q12272 snR61snR61 90 nt-0.84□□□□□ -2.54
TPT1Q12272 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.84□□□□□ -2.54
TPT1Q12272 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.85□□□□□ -2.55
TPT1Q12272 snR38snR38 95 nt-0.86□□□□□ -2.55
TPT1Q12272 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.86□□□□□ -2.55
TPT1Q12272 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.88□□□□□ -2.55
TPT1Q12272 Q0092Q0092 141 nt-0.91□□□□□ -2.56
TPT1Q12272 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.93□□□□□ -2.56
TPT1Q12272 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.97□□□□□ -2.56
TPT1Q12272 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.05□□□□□ -2.58
TPT1Q12272 Q0143Q0143 153 nt-1.07□□□□□ -2.58
TPT1Q12272 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.07□□□□□ -2.58
TPT1Q12272 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.08□□□□□ -2.58
TPT1Q12272 YKL225WYKL225W 348 nt-1.08□□□□□ -2.58
TPT1Q12272 snR77snR77 88 nt-1.1□□□□□ -2.59
TPT1Q12272 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.1□□□□□ -2.59
TPT1Q12272 snR62snR62 100 nt-1.11□□□□□ -2.59
TPT1Q12272 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.14□□□□□ -2.59
TPT1Q12272 YMR326CYMR326C 309 nt-1.27□□□□□ -2.61
TPT1Q12272 YHR217CYHR217C 462 nt-1.3□□□□□ -2.62
TPT1Q12272 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.3□□□□□ -2.62
TPT1Q12272 YNR077CYNR077C 255 nt-1.31□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27 ms