Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.19□□□□□ -2.38
VPS54Q12071 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.17□□□□□ -2.38
VPS54Q12071 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.17□□□□□ -2.38
VPS54Q12071 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.16□□□□□ -2.38
VPS54Q12071 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.16□□□□□ -2.38
VPS54Q12071 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.14□□□□□ -2.39
VPS54Q12071 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.13□□□□□ -2.39
VPS54Q12071 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.13□□□□□ -2.39
VPS54Q12071 YOR170WYOR170W 306 nt0.13□□□□□ -2.39
VPS54Q12071 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.12□□□□□ -2.39
VPS54Q12071 YNL338WYNL338W 159 nt0.12□□□□□ -2.39
VPS54Q12071 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.11□□□□□ -2.39
VPS54Q12071 YOR102WYOR102W 351 nt0.11□□□□□ -2.39
VPS54Q12071 SOV1YMR066W 2697 nt0.1□□□□□ -2.39
VPS54Q12071 EST1YLR233C 2100 nt0.1□□□□□ -2.39
VPS54Q12071 YGR151CYGR151C 336 nt0.1□□□□□ -2.39
VPS54Q12071 YBR099CYBR099C 384 nt0.1□□□□□ -2.39
VPS54Q12071 snR48snR48 113 nt0.08□□□□□ -2.4
VPS54Q12071 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.07□□□□□ -2.4
VPS54Q12071 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.06□□□□□ -2.4
VPS54Q12071 snR69snR69 101 nt0.03□□□□□ -2.4
VPS54Q12071 YGR164WYGR164W 336 nt0.03□□□□□ -2.4
VPS54Q12071 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.02□□□□□ -2.41
VPS54Q12071 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.01□□□□□ -2.41
VPS54Q12071 snR128snR128 126 nt0.01□□□□□ -2.41
VPS54Q12071 PMP2YEL017C-A 132 nt0□□□□□ -2.41
VPS54Q12071 YNL337WYNL337W 255 nt0□□□□□ -2.41
VPS54Q12071 YBR178WYBR178W 375 nt0□□□□□ -2.41
VPS54Q12071 snR45snR45 172 nt-0.02□□□□□ -2.41
VPS54Q12071 snR50snR50 90 nt-0.02□□□□□ -2.41
VPS54Q12071 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.03□□□□□ -2.41
VPS54Q12071 YNL205CYNL205C 423 nt-0.05□□□□□ -2.42
VPS54Q12071 SEC10YLR166C 2616 nt-0.05□□□□□ -2.42
VPS54Q12071 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.06□□□□□ -2.42
VPS54Q12071 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.06□□□□□ -2.42
VPS54Q12071 RDS3YPR094W 324 nt-0.06□□□□□ -2.42
VPS54Q12071 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.07□□□□□ -2.42
VPS54Q12071 YNL266WYNL266W 420 nt-0.07□□□□□ -2.42
VPS54Q12071 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.08□□□□□ -2.42
VPS54Q12071 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.08□□□□□ -2.42
VPS54Q12071 YOR225WYOR225W 330 nt-0.09□□□□□ -2.42
VPS54Q12071 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.1□□□□□ -2.43
VPS54Q12071 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.11□□□□□ -2.43
VPS54Q12071 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.11□□□□□ -2.43
VPS54Q12071 Q0032Q0032 291 nt-0.12□□□□□ -2.43
VPS54Q12071 YLR294CYLR294C 330 nt-0.12□□□□□ -2.43
VPS54Q12071 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.13□□□□□ -2.43
VPS54Q12071 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.14□□□□□ -2.43
VPS54Q12071 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.14□□□□□ -2.43
VPS54Q12071 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.14□□□□□ -2.43
VPS54Q12071 SBH2YER019C-A 267 nt-0.17□□□□□ -2.44
VPS54Q12071 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.18□□□□□ -2.44
VPS54Q12071 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.2□□□□□ -2.44
VPS54Q12071 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.22□□□□□ -2.44
VPS54Q12071 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.22□□□□□ -2.44
VPS54Q12071 snR67snR67 82 nt-0.23□□□□□ -2.45
VPS54Q12071 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.23□□□□□ -2.45
VPS54Q12071 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.24□□□□□ -2.45
VPS54Q12071 SKI7YOR076C 2244 nt-0.24□□□□□ -2.45
VPS54Q12071 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.28□□□□□ -2.45
VPS54Q12071 YNL170WYNL170W 396 nt-0.28□□□□□ -2.45
VPS54Q12071 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.3□□□□□ -2.46
VPS54Q12071 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.31□□□□□ -2.46
VPS54Q12071 snR81snR81 201 nt-0.32□□□□□ -2.46
VPS54Q12071 ATP8Q0080 147 nt-0.34□□□□□ -2.46
VPS54Q12071 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.36□□□□□ -2.47
VPS54Q12071 snR47snR47 99 nt-0.37□□□□□ -2.47
VPS54Q12071 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.38□□□□□ -2.47
VPS54Q12071 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.39□□□□□ -2.47
VPS54Q12071 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.39□□□□□ -2.47
VPS54Q12071 snR161snR161 161 nt-0.39□□□□□ -2.47
VPS54Q12071 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.41□□□□□ -2.48
VPS54Q12071 snR38snR38 95 nt-0.41□□□□□ -2.48
VPS54Q12071 RPL41AYDL184C 78 nt-0.42□□□□□ -2.48
VPS54Q12071 Q0092Q0092 141 nt-0.44□□□□□ -2.48
VPS54Q12071 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.44□□□□□ -2.48
VPS54Q12071 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.44□□□□□ -2.48
VPS54Q12071 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.45□□□□□ -2.48
VPS54Q12071 snR61snR61 90 nt-0.46□□□□□ -2.48
VPS54Q12071 snR33snR33 183 nt-0.46□□□□□ -2.48
VPS54Q12071 URB1YKL014C 5295 nt-0.48□□□□□ -2.49
VPS54Q12071 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.5□□□□□ -2.49
VPS54Q12071 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.51□□□□□ -2.49
VPS54Q12071 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.52□□□□□ -2.49
VPS54Q12071 Q0143Q0143 153 nt-0.54□□□□□ -2.5
VPS54Q12071 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.54□□□□□ -2.5
VPS54Q12071 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.55□□□□□ -2.5
VPS54Q12071 snR77snR77 88 nt-0.56□□□□□ -2.5
VPS54Q12071 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
VPS54Q12071 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
VPS54Q12071 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
VPS54Q12071 YKL225WYKL225W 348 nt-0.57□□□□□ -2.5
VPS54Q12071 snR62snR62 100 nt-0.61□□□□□ -2.51
VPS54Q12071 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.62□□□□□ -2.51
VPS54Q12071 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
VPS54Q12071 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.66□□□□□ -2.52
VPS54Q12071 YBL109WYBL109W 336 nt-0.68□□□□□ -2.52
VPS54Q12071 snR85snR85 171 nt-0.69□□□□□ -2.52
VPS54Q12071 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.69□□□□□ -2.52
VPS54Q12071 YMR326CYMR326C 309 nt-0.7□□□□□ -2.52
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