Protein–RNA interactions for Protein: Q06091

SNT309, Pre-mRNA-splicing factor SNT309, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT309Q06091 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.09□□□□□ -2.4
SNT309Q06091 JLP2YMR132C 627 nt0.09□□□□□ -2.4
SNT309Q06091 EST1YLR233C 2100 nt0.07□□□□□ -2.4
SNT309Q06091 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.06□□□□□ -2.4
SNT309Q06091 snR128snR128 126 nt0.04□□□□□ -2.4
SNT309Q06091 ESP1YGR098C 4893 nt0.03□□□□□ -2.4
SNT309Q06091 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.03□□□□□ -2.4
SNT309Q06091 snR48snR48 113 nt0.03□□□□□ -2.4
SNT309Q06091 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.02□□□□□ -2.41
SNT309Q06091 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.02□□□□□ -2.41
SNT309Q06091 THO2YNL139C 4794 nt0.01□□□□□ -2.41
SNT309Q06091 YOR102WYOR102W 351 nt0□□□□□ -2.41
SNT309Q06091 YJL150WYJL150W 303 nt-0.03□□□□□ -2.41
SNT309Q06091 SOV1YMR066W 2697 nt-0.03□□□□□ -2.41
SNT309Q06091 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.06□□□□□ -2.42
SNT309Q06091 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.06□□□□□ -2.42
SNT309Q06091 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.07□□□□□ -2.42
SNT309Q06091 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.09□□□□□ -2.42
SNT309Q06091 snR69snR69 101 nt-0.1□□□□□ -2.43
SNT309Q06091 snR45snR45 172 nt-0.1□□□□□ -2.43
SNT309Q06091 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.12□□□□□ -2.43
SNT309Q06091 YGR164WYGR164W 336 nt-0.12□□□□□ -2.43
SNT309Q06091 YNL205CYNL205C 423 nt-0.12□□□□□ -2.43
SNT309Q06091 YNL198CYNL198C 303 nt-0.15□□□□□ -2.43
SNT309Q06091 RDS3YPR094W 324 nt-0.15□□□□□ -2.43
SNT309Q06091 YGR151CYGR151C 336 nt-0.17□□□□□ -2.44
SNT309Q06091 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.19□□□□□ -2.44
SNT309Q06091 SBH2YER019C-A 267 nt-0.21□□□□□ -2.44
SNT309Q06091 YNL337WYNL337W 255 nt-0.21□□□□□ -2.44
SNT309Q06091 SEC10YLR166C 2616 nt-0.22□□□□□ -2.45
SNT309Q06091 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.24□□□□□ -2.45
SNT309Q06091 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.28□□□□□ -2.45
SNT309Q06091 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.28□□□□□ -2.45
SNT309Q06091 YBL053WYBL053W 375 nt-0.28□□□□□ -2.45
SNT309Q06091 YBR178WYBR178W 375 nt-0.28□□□□□ -2.45
SNT309Q06091 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.3□□□□□ -2.46
SNT309Q06091 YNL338WYNL338W 159 nt-0.3□□□□□ -2.46
SNT309Q06091 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.31□□□□□ -2.46
SNT309Q06091 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.31□□□□□ -2.46
SNT309Q06091 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.31□□□□□ -2.46
SNT309Q06091 YNL266WYNL266W 420 nt-0.32□□□□□ -2.46
SNT309Q06091 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.33□□□□□ -2.46
SNT309Q06091 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.33□□□□□ -2.46
SNT309Q06091 snR50snR50 90 nt-0.33□□□□□ -2.46
SNT309Q06091 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.34□□□□□ -2.46
SNT309Q06091 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.34□□□□□ -2.46
SNT309Q06091 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.34□□□□□ -2.46
SNT309Q06091 Q0032Q0032 291 nt-0.37□□□□□ -2.47
SNT309Q06091 snR67snR67 82 nt-0.43□□□□□ -2.48
SNT309Q06091 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.43□□□□□ -2.48
SNT309Q06091 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.47□□□□□ -2.48
SNT309Q06091 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.5□□□□□ -2.49
SNT309Q06091 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.54□□□□□ -2.5
SNT309Q06091 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.54□□□□□ -2.5
SNT309Q06091 URB1YKL014C 5295 nt-0.61□□□□□ -2.51
SNT309Q06091 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.65□□□□□ -2.51
SNT309Q06091 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.67□□□□□ -2.52
SNT309Q06091 SKI7YOR076C 2244 nt-0.71□□□□□ -2.52
SNT309Q06091 YLR294CYLR294C 330 nt-0.72□□□□□ -2.52
SNT309Q06091 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.76□□□□□ -2.53
SNT309Q06091 YOR225WYOR225W 330 nt-0.76□□□□□ -2.53
SNT309Q06091 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
SNT309Q06091 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
SNT309Q06091 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
SNT309Q06091 snR161snR161 161 nt-0.78□□□□□ -2.53
SNT309Q06091 snR33snR33 183 nt-0.78□□□□□ -2.53
SNT309Q06091 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.79□□□□□ -2.54
SNT309Q06091 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.84□□□□□ -2.54
SNT309Q06091 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.86□□□□□ -2.55
SNT309Q06091 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.88□□□□□ -2.55
SNT309Q06091 RPL41AYDL184C 78 nt-0.9□□□□□ -2.55
SNT309Q06091 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.92□□□□□ -2.56
SNT309Q06091 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.92□□□□□ -2.56
SNT309Q06091 YNL170WYNL170W 396 nt-0.94□□□□□ -2.56
SNT309Q06091 snR81snR81 201 nt-0.97□□□□□ -2.56
SNT309Q06091 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1□□□□□ -2.57
SNT309Q06091 snR47snR47 99 nt-1.01□□□□□ -2.57
SNT309Q06091 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.02□□□□□ -2.57
SNT309Q06091 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.03□□□□□ -2.57
SNT309Q06091 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.04□□□□□ -2.58
SNT309Q06091 snR61snR61 90 nt-1.05□□□□□ -2.58
SNT309Q06091 ATP8Q0080 147 nt-1.07□□□□□ -2.58
SNT309Q06091 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.08□□□□□ -2.58
SNT309Q06091 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.08□□□□□ -2.58
SNT309Q06091 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.1□□□□□ -2.59
SNT309Q06091 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.12□□□□□ -2.59
SNT309Q06091 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.18□□□□□ -2.6
SNT309Q06091 snR38snR38 95 nt-1.18□□□□□ -2.6
SNT309Q06091 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.27□□□□□ -2.61
SNT309Q06091 Q0092Q0092 141 nt-1.29□□□□□ -2.62
SNT309Q06091 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.3□□□□□ -2.62
SNT309Q06091 YKL225WYKL225W 348 nt-1.3□□□□□ -2.62
SNT309Q06091 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.32□□□□□ -2.62
SNT309Q06091 snR77snR77 88 nt-1.34□□□□□ -2.62
SNT309Q06091 snR62snR62 100 nt-1.35□□□□□ -2.63
SNT309Q06091 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.41□□□□□ -2.64
SNT309Q06091 YNR077CYNR077C 255 nt-1.42□□□□□ -2.64
SNT309Q06091 Q0143Q0143 153 nt-1.44□□□□□ -2.64
SNT309Q06091 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.48□□□□□ -2.65
SNT309Q06091 YMR326CYMR326C 309 nt-1.51□□□□□ -2.65
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