Protein–RNA interactions for Protein: Q06053

DUS3, tRNA-dihydrouridine(47) synthase [NAD(P)(+)], yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DUS3Q06053 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.05□□□□□ -2.24
DUS3Q06053 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.05□□□□□ -2.24
DUS3Q06053 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
DUS3Q06053 snR81snR81 201 nt1.04□□□□□ -2.24
DUS3Q06053 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.04□□□□□ -2.24
DUS3Q06053 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.03□□□□□ -2.24
DUS3Q06053 NIP1YMR309C 2439 nt1.01□□□□□ -2.25
DUS3Q06053 UTP20YBL004W 7482 nt1□□□□□ -2.25
DUS3Q06053 CSE1YGL238W 2883 nt0.99□□□□□ -2.25
DUS3Q06053 YJR029WYJR029W 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
DUS3Q06053 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
DUS3Q06053 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.96□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.96□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 EST1YLR233C 2100 nt0.96□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 snR69snR69 101 nt0.95□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.92□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 RPS26AYGL189C 360 nt0.92□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.92□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.92□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.91□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 PET111YMR257C 2403 nt0.91□□□□□ -2.26
DUS3Q06053 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.9□□□□□ -2.27
DUS3Q06053 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.88□□□□□ -2.27
DUS3Q06053 RDS3YPR094W 324 nt0.88□□□□□ -2.27
DUS3Q06053 YMR160WYMR160W 2451 nt0.86□□□□□ -2.27
DUS3Q06053 YOL014WYOL014W 375 nt0.86□□□□□ -2.27
DUS3Q06053 IQG1YPL242C 4488 nt0.85□□□□□ -2.27
DUS3Q06053 MLP1YKR095W 5628 nt0.84□□□□□ -2.27
DUS3Q06053 snR62snR62 100 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.82□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.81□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.81□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.8□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.79□□□□□ -2.28
DUS3Q06053 ORC3YLL004W 1851 nt0.78□□□□□ -2.29
DUS3Q06053 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.77□□□□□ -2.29
DUS3Q06053 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.77□□□□□ -2.29
DUS3Q06053 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.76□□□□□ -2.29
DUS3Q06053 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.75□□□□□ -2.29
DUS3Q06053 snR45snR45 172 nt0.73□□□□□ -2.29
DUS3Q06053 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.72□□□□□ -2.29
DUS3Q06053 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.72□□□□□ -2.29
DUS3Q06053 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.66□□□□□ -2.3
DUS3Q06053 FMP27YLR454W 7887 nt0.64□□□□□ -2.31
DUS3Q06053 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.64□□□□□ -2.31
DUS3Q06053 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
DUS3Q06053 snR47snR47 99 nt0.63□□□□□ -2.31
DUS3Q06053 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.62□□□□□ -2.31
DUS3Q06053 MLP2YIL149C 5040 nt0.61□□□□□ -2.31
DUS3Q06053 THO2YNL139C 4794 nt0.61□□□□□ -2.31
DUS3Q06053 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.31
DUS3Q06053 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.59□□□□□ -2.31
DUS3Q06053 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.58□□□□□ -2.32
DUS3Q06053 snR50snR50 90 nt0.58□□□□□ -2.32
DUS3Q06053 MYO1YHR023W 5787 nt0.57□□□□□ -2.32
DUS3Q06053 AI1Q0050 2505 nt0.57□□□□□ -2.32
DUS3Q06053 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.49□□□□□ -2.33
DUS3Q06053 RPL41AYDL184C 78 nt0.46□□□□□ -2.34
DUS3Q06053 snR67snR67 82 nt0.45□□□□□ -2.34
DUS3Q06053 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.45□□□□□ -2.34
DUS3Q06053 ESP1YGR098C 4893 nt0.45□□□□□ -2.34
DUS3Q06053 SOV1YMR066W 2697 nt0.43□□□□□ -2.34
DUS3Q06053 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.39□□□□□ -2.35
DUS3Q06053 YKL225WYKL225W 348 nt0.38□□□□□ -2.35
DUS3Q06053 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.36□□□□□ -2.35
DUS3Q06053 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.36□□□□□ -2.35
DUS3Q06053 snR38snR38 95 nt0.36□□□□□ -2.35
DUS3Q06053 snR64snR64 101 nt0.34□□□□□ -2.36
DUS3Q06053 snR128snR128 126 nt0.26□□□□□ -2.37
DUS3Q06053 snR53snR53 91 nt0.26□□□□□ -2.37
DUS3Q06053 SKI7YOR076C 2244 nt0.19□□□□□ -2.38
DUS3Q06053 PAU9YBL108C-A 129 nt0.05□□□□□ -2.4
DUS3Q06053 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.03□□□□□ -2.4
DUS3Q06053 YJL113WYJL113W 4647 nt0.03□□□□□ -2.41
DUS3Q06053 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0□□□□□ -2.41
DUS3Q06053 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.05□□□□□ -2.42
DUS3Q06053 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.06□□□□□ -2.42
DUS3Q06053 SBH2YER019C-A 267 nt-0.1□□□□□ -2.43
DUS3Q06053 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.11□□□□□ -2.43
DUS3Q06053 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.18□□□□□ -2.44
DUS3Q06053 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.18□□□□□ -2.44
DUS3Q06053 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.26□□□□□ -2.45
DUS3Q06053 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.31□□□□□ -2.46
DUS3Q06053 snR161snR161 161 nt-0.33□□□□□ -2.46
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