Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.59□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.59□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 UTP10YJL109C 5310 nt0.58□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.58□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 AI1Q0050 2505 nt0.58□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 IQG1YPL242C 4488 nt0.58□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 ORC3YLL004W 1851 nt0.57□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 Q0092Q0092 141 nt0.57□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 RPS26AYGL189C 360 nt0.57□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 NIP1YMR309C 2439 nt0.56□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.56□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 YNL170WYNL170W 396 nt0.56□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 FMP27YLR454W 7887 nt0.55□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.55□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 PET111YMR257C 2403 nt0.54□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 GLG1YKR058W 1851 nt0.53□□□□□ -2.32
RRN11Q04712 SBH1YER087C-B 249 nt0.52□□□□□ -2.33
RRN11Q04712 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.49□□□□□ -2.33
RRN11Q04712 CSE1YGL238W 2883 nt0.47□□□□□ -2.33
RRN11Q04712 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.47□□□□□ -2.33
RRN11Q04712 SOM1YEL059C-A 225 nt0.45□□□□□ -2.34
RRN11Q04712 RCO1YMR075W 2055 nt0.45□□□□□ -2.34
RRN11Q04712 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.44□□□□□ -2.34
RRN11Q04712 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.42□□□□□ -2.34
RRN11Q04712 EST1YLR233C 2100 nt0.4□□□□□ -2.35
RRN11Q04712 YNL205CYNL205C 423 nt0.39□□□□□ -2.35
RRN11Q04712 YBR099CYBR099C 384 nt0.39□□□□□ -2.35
RRN11Q04712 snR69snR69 101 nt0.37□□□□□ -2.35
RRN11Q04712 PMP2YEL017C-A 132 nt0.37□□□□□ -2.35
RRN11Q04712 MLP1YKR095W 5628 nt0.37□□□□□ -2.35
RRN11Q04712 YNL266WYNL266W 420 nt0.36□□□□□ -2.35
RRN11Q04712 YBR178WYBR178W 375 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN11Q04712 ESP1YGR098C 4893 nt0.34□□□□□ -2.35
RRN11Q04712 SEC10YLR166C 2616 nt0.33□□□□□ -2.36
RRN11Q04712 RPM2YML091C 3609 nt0.33□□□□□ -2.36
RRN11Q04712 MLP2YIL149C 5040 nt0.31□□□□□ -2.36
RRN11Q04712 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.3□□□□□ -2.36
RRN11Q04712 SOV1YMR066W 2697 nt0.29□□□□□ -2.36
RRN11Q04712 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.27□□□□□ -2.37
RRN11Q04712 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.25□□□□□ -2.37
RRN11Q04712 RDS3YPR094W 324 nt0.25□□□□□ -2.37
RRN11Q04712 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.25□□□□□ -2.37
RRN11Q04712 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.23□□□□□ -2.37
RRN11Q04712 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.23□□□□□ -2.37
RRN11Q04712 Q0143Q0143 153 nt0.22□□□□□ -2.37
RRN11Q04712 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.22□□□□□ -2.37
RRN11Q04712 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.22□□□□□ -2.37
RRN11Q04712 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.21□□□□□ -2.38
RRN11Q04712 snR50snR50 90 nt0.21□□□□□ -2.38
RRN11Q04712 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.18□□□□□ -2.38
RRN11Q04712 snR81snR81 201 nt0.15□□□□□ -2.39
RRN11Q04712 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.15□□□□□ -2.39
RRN11Q04712 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.13□□□□□ -2.39
RRN11Q04712 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.13□□□□□ -2.39
RRN11Q04712 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.13□□□□□ -2.39
RRN11Q04712 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.12□□□□□ -2.39
RRN11Q04712 snR61snR61 90 nt0.11□□□□□ -2.39
RRN11Q04712 snR85snR85 171 nt0.1□□□□□ -2.39
RRN11Q04712 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.07□□□□□ -2.4
RRN11Q04712 TFB5YDR079C-A 219 nt0.06□□□□□ -2.4
RRN11Q04712 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.06□□□□□ -2.4
RRN11Q04712 snR128snR128 126 nt0.06□□□□□ -2.4
RRN11Q04712 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.04□□□□□ -2.4
RRN11Q04712 snR45snR45 172 nt0.04□□□□□ -2.4
RRN11Q04712 YBL109WYBL109W 336 nt0.01□□□□□ -2.41
RRN11Q04712 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.01□□□□□ -2.41
RRN11Q04712 snR67snR67 82 nt-0.03□□□□□ -2.41
RRN11Q04712 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.07□□□□□ -2.42
RRN11Q04712 SKI7YOR076C 2244 nt-0.07□□□□□ -2.42
RRN11Q04712 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.08□□□□□ -2.42
RRN11Q04712 snR47snR47 99 nt-0.08□□□□□ -2.42
RRN11Q04712 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.11□□□□□ -2.43
RRN11Q04712 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.11□□□□□ -2.43
RRN11Q04712 YHR217CYHR217C 462 nt-0.13□□□□□ -2.43
RRN11Q04712 YMR326CYMR326C 309 nt-0.13□□□□□ -2.43
RRN11Q04712 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.15□□□□□ -2.43
RRN11Q04712 snR38snR38 95 nt-0.15□□□□□ -2.43
RRN11Q04712 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.18□□□□□ -2.44
RRN11Q04712 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-0.2□□□□□ -2.44
RRN11Q04712 snR62snR62 100 nt-0.21□□□□□ -2.44
RRN11Q04712 RPL41AYDL184C 78 nt-0.21□□□□□ -2.44
RRN11Q04712 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.21□□□□□ -2.44
RRN11Q04712 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.22□□□□□ -2.44
RRN11Q04712 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.22□□□□□ -2.44
RRN11Q04712 SBH2YER019C-A 267 nt-0.24□□□□□ -2.45
RRN11Q04712 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.29□□□□□ -2.46
RRN11Q04712 YKL225WYKL225W 348 nt-0.32□□□□□ -2.46
RRN11Q04712 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.34□□□□□ -2.46
RRN11Q04712 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.37□□□□□ -2.47
RRN11Q04712 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.41□□□□□ -2.48
RRN11Q04712 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-0.45□□□□□ -2.48
RRN11Q04712 snR161snR161 161 nt-0.45□□□□□ -2.48
RRN11Q04712 snR64snR64 101 nt-0.48□□□□□ -2.49
RRN11Q04712 URB1YKL014C 5295 nt-0.5□□□□□ -2.49
RRN11Q04712 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.51□□□□□ -2.49
RRN11Q04712 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.57□□□□□ -2.5
RRN11Q04712 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.63□□□□□ -2.51
RRN11Q04712 snR77snR77 88 nt-0.65□□□□□ -2.51
RRN11Q04712 snR33snR33 183 nt-0.66□□□□□ -2.52
RRN11Q04712 snR53snR53 91 nt-0.7□□□□□ -2.52
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