Protein–RNA interactions for Protein: Q04549

ARP10, Actin-like protein ARP10, yeastyeast

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARP10Q04549 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ARP10Q04549 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ARP10Q04549 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ARP10Q04549 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ARP10Q04549 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ARP10Q04549 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ARP10Q04549 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ARP10Q04549 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ARP10Q04549 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ARP10Q04549 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ARP10Q04549 YBR099CYBR099C 384 nt0.59□□□□□ -2.31
ARP10Q04549 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.58□□□□□ -2.32
ARP10Q04549 YNL205CYNL205C 423 nt0.58□□□□□ -2.32
ARP10Q04549 SBH1YER087C-B 249 nt0.57□□□□□ -2.32
ARP10Q04549 UTP10YJL109C 5310 nt0.57□□□□□ -2.32
ARP10Q04549 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.57□□□□□ -2.32
ARP10Q04549 BIR1YJR089W 2865 nt0.56□□□□□ -2.32
ARP10Q04549 YMR160WYMR160W 2451 nt0.56□□□□□ -2.32
ARP10Q04549 YOL014WYOL014W 375 nt0.54□□□□□ -2.32
ARP10Q04549 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.52□□□□□ -2.33
ARP10Q04549 RCO1YMR075W 2055 nt0.52□□□□□ -2.33
ARP10Q04549 YNL266WYNL266W 420 nt0.51□□□□□ -2.33
ARP10Q04549 PMP2YEL017C-A 132 nt0.5□□□□□ -2.33
ARP10Q04549 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.5□□□□□ -2.33
ARP10Q04549 EST1YLR233C 2100 nt0.49□□□□□ -2.33
ARP10Q04549 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.48□□□□□ -2.33
ARP10Q04549 snR69snR69 101 nt0.48□□□□□ -2.33
ARP10Q04549 YBR178WYBR178W 375 nt0.48□□□□□ -2.33
ARP10Q04549 MLP1YKR095W 5628 nt0.47□□□□□ -2.33
ARP10Q04549 SEC10YLR166C 2616 nt0.46□□□□□ -2.34
ARP10Q04549 Q0143Q0143 153 nt0.46□□□□□ -2.34
ARP10Q04549 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.41□□□□□ -2.34
ARP10Q04549 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.4□□□□□ -2.35
ARP10Q04549 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.4□□□□□ -2.35
ARP10Q04549 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.39□□□□□ -2.35
ARP10Q04549 AI1Q0050 2505 nt0.38□□□□□ -2.35
ARP10Q04549 snR85snR85 171 nt0.38□□□□□ -2.35
ARP10Q04549 RDS3YPR094W 324 nt0.37□□□□□ -2.35
ARP10Q04549 IQG1YPL242C 4488 nt0.36□□□□□ -2.35
ARP10Q04549 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.35□□□□□ -2.35
ARP10Q04549 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.34□□□□□ -2.36
ARP10Q04549 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.34□□□□□ -2.36
ARP10Q04549 FMP27YLR454W 7887 nt0.33□□□□□ -2.36
ARP10Q04549 ESP1YGR098C 4893 nt0.32□□□□□ -2.36
ARP10Q04549 snR61snR61 90 nt0.31□□□□□ -2.36
ARP10Q04549 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.29□□□□□ -2.36
ARP10Q04549 SOV1YMR066W 2697 nt0.28□□□□□ -2.36
ARP10Q04549 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.28□□□□□ -2.36
ARP10Q04549 THO2YNL139C 4794 nt0.26□□□□□ -2.37
ARP10Q04549 snR81snR81 201 nt0.26□□□□□ -2.37
ARP10Q04549 TFB5YDR079C-A 219 nt0.26□□□□□ -2.37
ARP10Q04549 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.26□□□□□ -2.37
ARP10Q04549 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.25□□□□□ -2.37
ARP10Q04549 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.25□□□□□ -2.37
ARP10Q04549 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.25□□□□□ -2.37
ARP10Q04549 snR50snR50 90 nt0.24□□□□□ -2.37
ARP10Q04549 MLP2YIL149C 5040 nt0.24□□□□□ -2.37
ARP10Q04549 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.23□□□□□ -2.37
ARP10Q04549 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.23□□□□□ -2.37
ARP10Q04549 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.21□□□□□ -2.38
ARP10Q04549 YBL109WYBL109W 336 nt0.16□□□□□ -2.38
ARP10Q04549 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.13□□□□□ -2.39
ARP10Q04549 YMR326CYMR326C 309 nt0.11□□□□□ -2.39
ARP10Q04549 snR128snR128 126 nt0.11□□□□□ -2.39
ARP10Q04549 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.09□□□□□ -2.4
ARP10Q04549 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.09□□□□□ -2.4
ARP10Q04549 YHR217CYHR217C 462 nt0.08□□□□□ -2.4
ARP10Q04549 snR67snR67 82 nt0.06□□□□□ -2.4
ARP10Q04549 snR45snR45 172 nt0.05□□□□□ -2.4
ARP10Q04549 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.04□□□□□ -2.4
ARP10Q04549 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.04□□□□□ -2.4
ARP10Q04549 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt0.03□□□□□ -2.4
ARP10Q04549 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.02□□□□□ -2.41
ARP10Q04549 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.01□□□□□ -2.41
ARP10Q04549 snR47snR47 99 nt0.01□□□□□ -2.41
ARP10Q04549 snR62snR62 100 nt-0.06□□□□□ -2.42
ARP10Q04549 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.06□□□□□ -2.42
ARP10Q04549 SKI7YOR076C 2244 nt-0.08□□□□□ -2.42
ARP10Q04549 RPL41AYDL184C 78 nt-0.11□□□□□ -2.43
ARP10Q04549 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.11□□□□□ -2.43
ARP10Q04549 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.12□□□□□ -2.43
ARP10Q04549 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.12□□□□□ -2.43
ARP10Q04549 snR38snR38 95 nt-0.13□□□□□ -2.43
ARP10Q04549 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.2□□□□□ -2.44
ARP10Q04549 SBH2YER019C-A 267 nt-0.21□□□□□ -2.44
ARP10Q04549 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.21□□□□□ -2.44
ARP10Q04549 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-0.22□□□□□ -2.44
ARP10Q04549 YKL225WYKL225W 348 nt-0.25□□□□□ -2.45
ARP10Q04549 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.36□□□□□ -2.47
ARP10Q04549 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.38□□□□□ -2.47
ARP10Q04549 snR64snR64 101 nt-0.4□□□□□ -2.47
ARP10Q04549 snR161snR161 161 nt-0.45□□□□□ -2.48
ARP10Q04549 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.47□□□□□ -2.48
ARP10Q04549 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.52□□□□□ -2.49
ARP10Q04549 URB1YKL014C 5295 nt-0.54□□□□□ -2.5
ARP10Q04549 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.54□□□□□ -2.5
ARP10Q04549 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.59□□□□□ -2.5
ARP10Q04549 snR53snR53 91 nt-0.6□□□□□ -2.51
ARP10Q04549 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
ARP10Q04549 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
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