Protein–RNA interactions for Protein: P48569

YDL183C, Uncharacterized protein YDL183C, yeastyeast

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL183CP48569 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.63□□□□□ -2.31
YDL183CP48569 BUL2YML111W 2763 nt0.62□□□□□ -2.31
YDL183CP48569 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.62□□□□□ -2.31
YDL183CP48569 ORC3YLL004W 1851 nt0.61□□□□□ -2.31
YDL183CP48569 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.61□□□□□ -2.31
YDL183CP48569 UTP10YJL109C 5310 nt0.61□□□□□ -2.31
YDL183CP48569 RCO1YMR075W 2055 nt0.6□□□□□ -2.31
YDL183CP48569 snR69snR69 101 nt0.6□□□□□ -2.31
YDL183CP48569 EST1YLR233C 2100 nt0.59□□□□□ -2.32
YDL183CP48569 snR61snR61 90 nt0.58□□□□□ -2.32
YDL183CP48569 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.57□□□□□ -2.32
YDL183CP48569 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.55□□□□□ -2.32
YDL183CP48569 RDS3YPR094W 324 nt0.55□□□□□ -2.32
YDL183CP48569 FMP27YLR454W 7887 nt0.54□□□□□ -2.32
YDL183CP48569 TFB5YDR079C-A 219 nt0.54□□□□□ -2.32
YDL183CP48569 YMR160WYMR160W 2451 nt0.54□□□□□ -2.32
YDL183CP48569 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.53□□□□□ -2.32
YDL183CP48569 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.52□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.5□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.47□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.47□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 YMR326CYMR326C 309 nt0.47□□□□□ -2.33
YDL183CP48569 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.45□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.44□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.43□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 AI1Q0050 2505 nt0.42□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.42□□□□□ -2.34
YDL183CP48569 IQG1YPL242C 4488 nt0.39□□□□□ -2.35
YDL183CP48569 MLP2YIL149C 5040 nt0.38□□□□□ -2.35
YDL183CP48569 snR81snR81 201 nt0.38□□□□□ -2.35
YDL183CP48569 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt0.36□□□□□ -2.35
YDL183CP48569 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.36□□□□□ -2.35
YDL183CP48569 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.34□□□□□ -2.36
YDL183CP48569 YHR217CYHR217C 462 nt0.34□□□□□ -2.36
YDL183CP48569 YBL109WYBL109W 336 nt0.34□□□□□ -2.36
YDL183CP48569 THO2YNL139C 4794 nt0.33□□□□□ -2.36
YDL183CP48569 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.33□□□□□ -2.36
YDL183CP48569 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.32□□□□□ -2.36
YDL183CP48569 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.31□□□□□ -2.36
YDL183CP48569 snR50snR50 90 nt0.3□□□□□ -2.36
YDL183CP48569 YOL014WYOL014W 375 nt0.29□□□□□ -2.36
YDL183CP48569 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.28□□□□□ -2.36
YDL183CP48569 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.25□□□□□ -2.37
YDL183CP48569 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.24□□□□□ -2.37
YDL183CP48569 snR128snR128 126 nt0.22□□□□□ -2.37
YDL183CP48569 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.2□□□□□ -2.38
YDL183CP48569 snR67snR67 82 nt0.19□□□□□ -2.38
YDL183CP48569 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.18□□□□□ -2.38
YDL183CP48569 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.18□□□□□ -2.38
YDL183CP48569 SOV1YMR066W 2697 nt0.17□□□□□ -2.38
YDL183CP48569 ESP1YGR098C 4893 nt0.17□□□□□ -2.38
YDL183CP48569 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.16□□□□□ -2.38
YDL183CP48569 snR47snR47 99 nt0.15□□□□□ -2.39
YDL183CP48569 snR62snR62 100 nt0.12□□□□□ -2.39
YDL183CP48569 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.12□□□□□ -2.39
YDL183CP48569 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.12□□□□□ -2.39
YDL183CP48569 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.09□□□□□ -2.4
YDL183CP48569 RPL41AYDL184C 78 nt0.07□□□□□ -2.4
YDL183CP48569 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.05□□□□□ -2.4
YDL183CP48569 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.03□□□□□ -2.4
YDL183CP48569 PAU9YBL108C-A 129 nt0□□□□□ -2.41
YDL183CP48569 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0□□□□□ -2.41
YDL183CP48569 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.02□□□□□ -2.41
YDL183CP48569 snR45snR45 172 nt-0.05□□□□□ -2.42
YDL183CP48569 SBH2YER019C-A 267 nt-0.1□□□□□ -2.43
YDL183CP48569 SKI7YOR076C 2244 nt-0.13□□□□□ -2.43
YDL183CP48569 YKL225WYKL225W 348 nt-0.14□□□□□ -2.43
YDL183CP48569 snR38snR38 95 nt-0.17□□□□□ -2.44
YDL183CP48569 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.2□□□□□ -2.44
YDL183CP48569 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.26□□□□□ -2.45
YDL183CP48569 snR64snR64 101 nt-0.28□□□□□ -2.45
YDL183CP48569 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.29□□□□□ -2.46
YDL183CP48569 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.42□□□□□ -2.48
YDL183CP48569 snR161snR161 161 nt-0.42□□□□□ -2.48
YDL183CP48569 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.49□□□□□ -2.49
YDL183CP48569 snR33snR33 183 nt-0.49□□□□□ -2.49
YDL183CP48569 snR53snR53 91 nt-0.49□□□□□ -2.49
YDL183CP48569 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.52□□□□□ -2.49
YDL183CP48569 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.52□□□□□ -2.49
YDL183CP48569 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.54□□□□□ -2.5
YDL183CP48569 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.54□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.9 ms