Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 319.9 ms