Protein–RNA interactions for Protein: P47005

DAS1, F-box protein DAS1, yeastyeast

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DAS1P47005 RKR1YMR247C 4689 nt1.16□□□□□ -2.22
DAS1P47005 ULP2YIL031W 3105 nt1.15□□□□□ -2.22
DAS1P47005 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.15□□□□□ -2.22
DAS1P47005 GLG1YKR058W 1851 nt1.15□□□□□ -2.23
DAS1P47005 ORC3YLL004W 1851 nt1.15□□□□□ -2.23
DAS1P47005 EST1YLR233C 2100 nt1.14□□□□□ -2.23
DAS1P47005 LTE1YAL024C 4308 nt1.14□□□□□ -2.23
DAS1P47005 HUG1YML058W-A 207 nt1.12□□□□□ -2.23
DAS1P47005 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.11□□□□□ -2.23
DAS1P47005 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.1□□□□□ -2.23
DAS1P47005 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.1□□□□□ -2.23
DAS1P47005 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.1□□□□□ -2.23
DAS1P47005 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.1□□□□□ -2.23
DAS1P47005 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.1□□□□□ -2.23
DAS1P47005 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.1□□□□□ -2.23
DAS1P47005 VAM6YDL077C 3150 nt1.1□□□□□ -2.23
DAS1P47005 CSE1YGL238W 2883 nt1.08□□□□□ -2.24
DAS1P47005 snR47snR47 99 nt1.08□□□□□ -2.24
DAS1P47005 snR69snR69 101 nt1.07□□□□□ -2.24
DAS1P47005 BUL2YML111W 2763 nt1.06□□□□□ -2.24
DAS1P47005 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.06□□□□□ -2.24
DAS1P47005 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt1.04□□□□□ -2.24
DAS1P47005 NIP1YMR309C 2439 nt1.03□□□□□ -2.25
DAS1P47005 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.02□□□□□ -2.25
DAS1P47005 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.01□□□□□ -2.25
DAS1P47005 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1□□□□□ -2.25
DAS1P47005 IQG1YPL242C 4488 nt0.99□□□□□ -2.25
DAS1P47005 DOP1YDR141C 5097 nt0.98□□□□□ -2.25
DAS1P47005 RDS3YPR094W 324 nt0.97□□□□□ -2.25
DAS1P47005 PAU12YGR294W 363 nt0.96□□□□□ -2.26
DAS1P47005 PAU24YBR301W 363 nt0.96□□□□□ -2.26
DAS1P47005 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.91□□□□□ -2.26
DAS1P47005 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.9□□□□□ -2.27
DAS1P47005 snR64snR64 101 nt0.89□□□□□ -2.27
DAS1P47005 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.88□□□□□ -2.27
DAS1P47005 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.87□□□□□ -2.27
DAS1P47005 snR38snR38 95 nt0.87□□□□□ -2.27
DAS1P47005 snR53snR53 91 nt0.87□□□□□ -2.27
DAS1P47005 YKL225WYKL225W 348 nt0.86□□□□□ -2.27
DAS1P47005 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.85□□□□□ -2.27
DAS1P47005 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.83□□□□□ -2.28
DAS1P47005 UTP20YBL004W 7482 nt0.83□□□□□ -2.28
DAS1P47005 snR50snR50 90 nt0.82□□□□□ -2.28
DAS1P47005 AI1Q0050 2505 nt0.81□□□□□ -2.28
DAS1P47005 MLP1YKR095W 5628 nt0.81□□□□□ -2.28
DAS1P47005 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.8□□□□□ -2.28
DAS1P47005 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.79□□□□□ -2.28
DAS1P47005 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DAS1P47005 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DAS1P47005 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DAS1P47005 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DAS1P47005 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DAS1P47005 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DAS1P47005 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DAS1P47005 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DAS1P47005 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DAS1P47005 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DAS1P47005 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DAS1P47005 YMR160WYMR160W 2451 nt0.78□□□□□ -2.28
DAS1P47005 RPL41AYDL184C 78 nt0.78□□□□□ -2.28
DAS1P47005 PET111YMR257C 2403 nt0.78□□□□□ -2.28
DAS1P47005 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.76□□□□□ -2.29
DAS1P47005 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.75□□□□□ -2.29
DAS1P47005 MLP2YIL149C 5040 nt0.74□□□□□ -2.29
DAS1P47005 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.72□□□□□ -2.29
DAS1P47005 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.7□□□□□ -2.3
DAS1P47005 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.7□□□□□ -2.3
DAS1P47005 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.7□□□□□ -2.3
DAS1P47005 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
DAS1P47005 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
DAS1P47005 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.7□□□□□ -2.3
DAS1P47005 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
DAS1P47005 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
DAS1P47005 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.68□□□□□ -2.3
DAS1P47005 UTP10YJL109C 5310 nt0.63□□□□□ -2.31
DAS1P47005 FMP27YLR454W 7887 nt0.61□□□□□ -2.31
DAS1P47005 snR67snR67 82 nt0.59□□□□□ -2.31
DAS1P47005 SKI7YOR076C 2244 nt0.58□□□□□ -2.32
DAS1P47005 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.58□□□□□ -2.32
DAS1P47005 THO2YNL139C 4794 nt0.56□□□□□ -2.32
DAS1P47005 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.55□□□□□ -2.32
DAS1P47005 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.53□□□□□ -2.32
DAS1P47005 YOL014WYOL014W 375 nt0.52□□□□□ -2.33
DAS1P47005 SOV1YMR066W 2697 nt0.5□□□□□ -2.33
DAS1P47005 ESP1YGR098C 4893 nt0.47□□□□□ -2.33
DAS1P47005 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.45□□□□□ -2.34
DAS1P47005 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.44□□□□□ -2.34
DAS1P47005 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt0.36□□□□□ -2.35
DAS1P47005 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.36□□□□□ -2.35
DAS1P47005 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.35□□□□□ -2.35
DAS1P47005 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.3□□□□□ -2.36
DAS1P47005 snR128snR128 126 nt0.26□□□□□ -2.37
DAS1P47005 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.25□□□□□ -2.37
DAS1P47005 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.23□□□□□ -2.37
DAS1P47005 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.18□□□□□ -2.38
DAS1P47005 PAU9YBL108C-A 129 nt0.17□□□□□ -2.38
DAS1P47005 snR75snR75 89 nt0.14□□□□□ -2.39
DAS1P47005 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.14□□□□□ -2.39
DAS1P47005 snR77snR77 88 nt0.07□□□□□ -2.4
DAS1P47005 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.07□□□□□ -2.4
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