Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms