Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	tT(AGU)D	tT(AGU)D	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	tT(AGU)H	tT(AGU)H	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	tT(AGU)I1	tT(AGU)I1	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	tT(AGU)I2	tT(AGU)I2	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	tT(AGU)J	tT(AGU)J	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	tT(AGU)N1	tT(AGU)N1	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	tT(AGU)N2	tT(AGU)N2	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	tT(AGU)O1	tT(AGU)O1	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	tT(AGU)O2	tT(AGU)O2	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	CSE1	YGL238W	2883 nt		0.56	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	SBH1	YER087C-B	249 nt		0.56	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	PMP2	YEL017C-A	132 nt		0.53	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	YNL266W	YNL266W	420 nt		0.53	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	UTP20	YBL004W	7482 nt		0.53	□□□□□ -2.32
SIP1	P32578	YIL142C-A	YIL142C-A	333 nt		0.52	□□□□□ -2.33
SIP1	P32578	YNL054W-B	YNL054W-B	5250 nt		0.51	□□□□□ -2.33
SIP1	P32578	SEC10	YLR166C	2616 nt		0.51	□□□□□ -2.33
SIP1	P32578	YMR160W	YMR160W	2451 nt		0.5	□□□□□ -2.33
SIP1	P32578	EST1	YLR233C	2100 nt		0.5	□□□□□ -2.33
SIP1	P32578	Q0143	Q0143	153 nt		0.5	□□□□□ -2.33
SIP1	P32578	ESP1	YGR098C	4893 nt		0.49	□□□□□ -2.33
SIP1	P32578	snR69	snR69	101 nt		0.49	□□□□□ -2.33
SIP1	P32578	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		0.46	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	YBR178W	YBR178W	375 nt		0.45	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	MLP2	YIL149C	5040 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	tF(GAA)B	tF(GAA)B	73 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	tF(GAA)F	tF(GAA)F	73 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	tF(GAA)G	tF(GAA)G	73 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	tF(GAA)H1	tF(GAA)H1	73 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	tF(GAA)H2	tF(GAA)H2	73 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	tF(GAA)M	tF(GAA)M	73 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	tF(GAA)P1	tF(GAA)P1	73 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	tF(GAA)P2	tF(GAA)P2	73 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		0.42	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	YKL145W-A	YKL145W-A	93 nt		0.42	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	FMP27	YLR454W	7887 nt		0.41	□□□□□ -2.34
SIP1	P32578	RDS3	YPR094W	324 nt		0.4	□□□□□ -2.35
SIP1	P32578	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		0.39	□□□□□ -2.35
SIP1	P32578	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		0.39	□□□□□ -2.35
SIP1	P32578	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		0.38	□□□□□ -2.35
SIP1	P32578	snR85	snR85	171 nt		0.36	□□□□□ -2.35
SIP1	P32578	SOV1	YMR066W	2697 nt		0.35	□□□□□ -2.35
SIP1	P32578	snR61	snR61	90 nt		0.34	□□□□□ -2.36
SIP1	P32578	YOL014W	YOL014W	375 nt		0.33	□□□□□ -2.36
SIP1	P32578	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		0.32	□□□□□ -2.36
SIP1	P32578	AI1	Q0050	2505 nt		0.32	□□□□□ -2.36
SIP1	P32578	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		0.3	□□□□□ -2.36
SIP1	P32578	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		0.29	□□□□□ -2.36
SIP1	P32578	YOL013W-A	YOL013W-A	192 nt		0.29	□□□□□ -2.36
SIP1	P32578	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		0.27	□□□□□ -2.37
SIP1	P32578	snR81	snR81	201 nt		0.26	□□□□□ -2.37
SIP1	P32578	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		0.26	□□□□□ -2.37
SIP1	P32578	TFB5	YDR079C-A	219 nt		0.23	□□□□□ -2.37
SIP1	P32578	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		0.23	□□□□□ -2.37
SIP1	P32578	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		0.22	□□□□□ -2.37
SIP1	P32578	THO2	YNL139C	4794 nt		0.21	□□□□□ -2.38
SIP1	P32578	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		0.21	□□□□□ -2.38
SIP1	P32578	snR50	snR50	90 nt		0.2	□□□□□ -2.38
SIP1	P32578	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		0.19	□□□□□ -2.38
SIP1	P32578	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		0.13	□□□□□ -2.39
SIP1	P32578	YMR326C	YMR326C	309 nt		0.13	□□□□□ -2.39
SIP1	P32578	YER078W-A	YER078W-A	165 nt		0.12	□□□□□ -2.39
SIP1	P32578	YBL109W	YBL109W	336 nt		0.1	□□□□□ -2.39
SIP1	P32578	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		0.1	□□□□□ -2.39
SIP1	P32578	snR128	snR128	126 nt		0.09	□□□□□ -2.4
SIP1	P32578	YHR217C	YHR217C	462 nt		0.08	□□□□□ -2.4
SIP1	P32578	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		0.07	□□□□□ -2.4
SIP1	P32578	snR67	snR67	82 nt		0.04	□□□□□ -2.4
SIP1	P32578	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		0.02	□□□□□ -2.41
SIP1	P32578	YDR524C-A	YDR524C-A	120 nt		0	□□□□□ -2.41
SIP1	P32578	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		0	□□□□□ -2.41
SIP1	P32578	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
SIP1	P32578	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
SIP1	P32578	snR45	snR45	172 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
SIP1	P32578	snR62	snR62	100 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
SIP1	P32578	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
SIP1	P32578	snR47	snR47	99 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
SIP1	P32578	SKI7	YOR076C	2244 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
SIP1	P32578	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
SIP1	P32578	RPL41A	YDL184C	78 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
SIP1	P32578	snR38	snR38	95 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
SIP1	P32578	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
SIP1	P32578	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
SIP1	P32578	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
SIP1	P32578	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
SIP1	P32578	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
SIP1	P32578	YDL247W-A	YDL247W-A	75 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
SIP1	P32578	YKL225W	YKL225W	348 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
SIP1	P32578	YLL066W-B	YLL066W-B	171 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
SIP1	P32578	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
SIP1	P32578	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
SIP1	P32578	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
SIP1	P32578	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
SIP1	P32578	snR64	snR64	101 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
SIP1	P32578	snR161	snR161	161 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
SIP1	P32578	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SIP1	P32578	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
SIP1	P32578	snR53	snR53	91 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
SIP1	P32578	snR33	snR33	183 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
SIP1	P32578	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.69	□□□□□ -2.52

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