Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms