Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Psmb10O35955 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Psmb10O35955 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Psmb10O35955 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Psmb10O35955 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Psmb10O35955 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Psmb10O35955 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms