Protein–RNA interactions for Protein: D3YX71

Gm8973, Predicted gene 8973, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8973D3YX71 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8973D3YX71 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms