Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms