Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn6Q9Z262 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn6Q9Z262 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn6Q9Z262 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn6Q9Z262 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn6Q9Z262 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn6Q9Z262 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn6Q9Z262 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn6Q9Z262 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn6Q9Z262 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn6Q9Z262 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn6Q9Z262 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn6Q9Z262 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms