Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J1

Tcf7l1, Transcription factor 7-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7l1Q9Z1J1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf7l1Q9Z1J1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf7l1Q9Z1J1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcf7l1Q9Z1J1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcf7l1Q9Z1J1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcf7l1Q9Z1J1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf7l1Q9Z1J1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf7l1Q9Z1J1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf7l1Q9Z1J1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf7l1Q9Z1J1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcf7l1Q9Z1J1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf7l1Q9Z1J1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf7l1Q9Z1J1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf7l1Q9Z1J1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf7l1Q9Z1J1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms