Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shcbp1Q9Z179 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Shcbp1Q9Z179 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shcbp1Q9Z179 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Shcbp1Q9Z179 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shcbp1Q9Z179 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms