Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema4fQ9Z123 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4fQ9Z123 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema4fQ9Z123 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema4fQ9Z123 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema4fQ9Z123 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema4fQ9Z123 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema4fQ9Z123 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4fQ9Z123 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4fQ9Z123 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4fQ9Z123 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4fQ9Z123 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema4fQ9Z123 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4fQ9Z123 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4fQ9Z123 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema4fQ9Z123 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4fQ9Z123 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms