Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp2Q9Z0E6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gbp2Q9Z0E6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp2Q9Z0E6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp2Q9Z0E6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp2Q9Z0E6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms