Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cited4Q9WUL8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cited4Q9WUL8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cited4Q9WUL8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cited4Q9WUL8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.7 ms