Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skp1Q9WTX5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skp1Q9WTX5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skp1Q9WTX5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skp1Q9WTX5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skp1Q9WTX5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skp1Q9WTX5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skp1Q9WTX5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skp1Q9WTX5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skp1Q9WTX5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skp1Q9WTX5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skp1Q9WTX5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skp1Q9WTX5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skp1Q9WTX5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skp1Q9WTX5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Skp1Q9WTX5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skp1Q9WTX5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skp1Q9WTX5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms