Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6cQ9WTM3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6cQ9WTM3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema6cQ9WTM3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6cQ9WTM3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6cQ9WTM3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms