Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0W9

Chrna6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna6Q9R0W9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna6Q9R0W9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna6Q9R0W9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna6Q9R0W9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna6Q9R0W9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna6Q9R0W9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna6Q9R0W9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna6Q9R0W9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna6Q9R0W9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna6Q9R0W9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna6Q9R0W9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna6Q9R0W9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna6Q9R0W9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna6Q9R0W9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna6Q9R0W9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna6Q9R0W9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna6Q9R0W9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna6Q9R0W9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna6Q9R0W9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna6Q9R0W9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna6Q9R0W9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna6Q9R0W9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna6Q9R0W9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna6Q9R0W9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna6Q9R0W9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna6Q9R0W9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna6Q9R0W9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna6Q9R0W9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna6Q9R0W9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna6Q9R0W9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna6Q9R0W9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna6Q9R0W9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna6Q9R0W9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna6Q9R0W9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna6Q9R0W9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna6Q9R0W9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna6Q9R0W9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna6Q9R0W9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna6Q9R0W9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna6Q9R0W9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna6Q9R0W9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna6Q9R0W9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna6Q9R0W9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna6Q9R0W9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna6Q9R0W9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna6Q9R0W9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms