Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plod2Q9R0B9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod2Q9R0B9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod2Q9R0B9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Plod2Q9R0B9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plod2Q9R0B9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod2Q9R0B9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod2Q9R0B9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod2Q9R0B9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod2Q9R0B9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms