Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tk2Q9R088 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tk2Q9R088 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tk2Q9R088 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tk2Q9R088 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tk2Q9R088 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tk2Q9R088 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tk2Q9R088 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tk2Q9R088 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tk2Q9R088 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tk2Q9R088 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tk2Q9R088 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tk2Q9R088 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tk2Q9R088 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tk2Q9R088 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms