Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AmfrQ9R049 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
AmfrQ9R049 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AmfrQ9R049 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AmfrQ9R049 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AmfrQ9R049 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AmfrQ9R049 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AmfrQ9R049 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AmfrQ9R049 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AmfrQ9R049 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms