Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CtsfQ9R013 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CtsfQ9R013 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtsfQ9R013 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CtsfQ9R013 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CtsfQ9R013 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms