Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d3cQ9QZS8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh2d3cQ9QZS8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh2d3cQ9QZS8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms