Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nr2e3Q9QXZ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Nr2e3Q9QXZ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nr2e3Q9QXZ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nr2e3Q9QXZ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nr2e3Q9QXZ7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nr2e3Q9QXZ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nr2e3Q9QXZ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nr2e3Q9QXZ7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nr2e3Q9QXZ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nr2e3Q9QXZ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nr2e3Q9QXZ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nr2e3Q9QXZ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nr2e3Q9QXZ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nr2e3Q9QXZ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nr2e3Q9QXZ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nr2e3Q9QXZ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nr2e3Q9QXZ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nr2e3Q9QXZ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nr2e3Q9QXZ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nr2e3Q9QXZ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nr2e3Q9QXZ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nr2e3Q9QXZ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nr2e3Q9QXZ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nr2e3Q9QXZ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nr2e3Q9QXZ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nr2e3Q9QXZ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nr2e3Q9QXZ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nr2e3Q9QXZ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nr2e3Q9QXZ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr2e3Q9QXZ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr2e3Q9QXZ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms