Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG9

Tinf2, TERF1-interacting nuclear factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tinf2Q9QXG9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tinf2Q9QXG9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tinf2Q9QXG9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tinf2Q9QXG9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tinf2Q9QXG9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms