Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms