Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gkap1Q9JMB0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gkap1Q9JMB0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gkap1Q9JMB0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gkap1Q9JMB0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms