Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc4apQ9JLV2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc4apQ9JLV2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc4apQ9JLV2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc4apQ9JLV2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc4apQ9JLV2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc4apQ9JLV2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc4apQ9JLV2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc4apQ9JLV2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc4apQ9JLV2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms