Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI6

Scly, Selenocysteine lyase, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SclyQ9JLI6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SclyQ9JLI6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SclyQ9JLI6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SclyQ9JLI6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SclyQ9JLI6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SclyQ9JLI6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SclyQ9JLI6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SclyQ9JLI6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms