Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CtsmQ9JL96 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtsmQ9JL96 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtsmQ9JL96 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtsmQ9JL96 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CtsmQ9JL96 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtsmQ9JL96 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsmQ9JL96 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsmQ9JL96 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtsmQ9JL96 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtsmQ9JL96 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtsmQ9JL96 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtsmQ9JL96 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CtsmQ9JL96 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsmQ9JL96 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms