Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx5Q9JL61 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx5Q9JL61 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx5Q9JL61 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx5Q9JL61 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx5Q9JL61 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx5Q9JL61 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx5Q9JL61 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx5Q9JL61 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx5Q9JL61 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfx5Q9JL61 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx5Q9JL61 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx5Q9JL61 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rfx5Q9JL61 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx5Q9JL61 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx5Q9JL61 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx5Q9JL61 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx5Q9JL61 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx5Q9JL61 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx5Q9JL61 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx5Q9JL61 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx5Q9JL61 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx5Q9JL61 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx5Q9JL61 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx5Q9JL61 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx5Q9JL61 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx5Q9JL61 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx5Q9JL61 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfx5Q9JL61 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx5Q9JL61 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx5Q9JL61 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx5Q9JL61 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx5Q9JL61 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfx5Q9JL61 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfx5Q9JL61 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfx5Q9JL61 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfx5Q9JL61 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfx5Q9JL61 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms