Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ndufaf3Q9JKL4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufaf3Q9JKL4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndufaf3Q9JKL4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndufaf3Q9JKL4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms