Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bgrlQ9JJU8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bgrlQ9JJU8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms