Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bco1Q9JJS6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bco1Q9JJS6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bco1Q9JJS6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bco1Q9JJS6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco1Q9JJS6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco1Q9JJS6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco1Q9JJS6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco1Q9JJS6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bco1Q9JJS6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bco1Q9JJS6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bco1Q9JJS6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bco1Q9JJS6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Bco1Q9JJS6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bco1Q9JJS6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bco1Q9JJS6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bco1Q9JJS6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco1Q9JJS6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco1Q9JJS6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco1Q9JJS6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco1Q9JJS6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco1Q9JJS6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bco1Q9JJS6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bco1Q9JJS6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms