Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox1Q9JJF3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Riox1Q9JJF3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Riox1Q9JJF3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riox1Q9JJF3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Riox1Q9JJF3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riox1Q9JJF3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riox1Q9JJF3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riox1Q9JJF3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox1Q9JJF3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox1Q9JJF3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riox1Q9JJF3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riox1Q9JJF3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms