Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClpxQ9JHS4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClpxQ9JHS4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClpxQ9JHS4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClpxQ9JHS4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClpxQ9JHS4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClpxQ9JHS4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClpxQ9JHS4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClpxQ9JHS4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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