Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ush1cQ9ES64 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ush1cQ9ES64 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ush1cQ9ES64 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ush1cQ9ES64 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms