Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc4Q9ES56 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc4Q9ES56 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc4Q9ES56 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc4Q9ES56 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms