Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERS2

Ndufa13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa13Q9ERS2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufa13Q9ERS2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufa13Q9ERS2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndufa13Q9ERS2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufa13Q9ERS2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms